Как запускать скрипт IPython?

Внешний вызов

ipython script.ipy

Без указания интерпретатора необходимо установить шебанг и права

Шебанг

#!/usr/bin/env ipython

Права

chmod u+x script.ipy

Вызов

./script.ipy

Из интерактивной оболочки IPython или скрипта IPython

%run script.ipy

Если не указывать расширение .ipy, то будет попытка вызвать файл с расширеним .py

In [1]: %run script
ERROR:root:File `'script.py'` not found.